在使用液氮冷冻罐时，有一个关键操作需要注意，那就是有关于冷冻罐的消菌清洗，在使用完容器之后，务必要对其进行消菌清洗，使其干燥，避免残留细菌或水分腐蚀内胆，造成容器的损耗。

　　在液氮容器内的液氮挥发完后，其罐内剩余的物质会迅速融化，成为液体物质并附着在内胆上，若不及时对其进行清洗，则会腐蚀内胆；如果形成空洞，罐体就会报废，因此在罐内液氮耗尽后务必要及时的对其进行消菌清洗。因此说来，对液氮容器的消菌清洗还是很有必要的。在不使用罐体时，务必要使用清水将其内胆清洗干净，把水排出，使用吹风机吹干，放置在常温下备用。

　　液氮冷冻罐的清洗方式有很多，起先要将液氮从容器罐中移出，放置2~3天，待罐内的温度升高至0℃左右，再倒入30℃左右的温水，用布对其擦拭；若发现有融化物粘在内胆底部，务必要仔细清洗；接着用清水进行冲洗几次，将其罐体进行倒置，放置于室内较安全的地方，避免摔倒，对其进行自然风干。但在冲洗时要缓慢、轻柔、倒入水的清洗温度不能超过40℃、总重量不能超过2kg。

　　除此对液氮容器的消菌清洗外，在运输方面也需要格外的注意的，在其对容器的运输过程中，务必要使用木制框架对其进行垫层和固定。罐与罐之间需用填料隔开，避免碰撞和倾倒，以免影响对罐体的使用周期。